Continental Rail fue fundada el 17 de mayo de 2000 con el fin de operar en el transporte ferroviario de mercancías y estar preparada para la liberalización del transporte ferroviario de pasajeros.
En cuanto a servicios de transporte de mercancías en la red convencional, Continental Rail realiza transporte regular de contenedores entre el Puerto de Valencia y las terminales de Madrid-Abroñigal y Puerto Seco de Coslada; entre Valladolid y el Puerto de Valencia; entre el Puerto de Valencia y León; entre el Puerto de Bilbao y las terminales de Silla, Madrid-Abroñigal y Barcelona-Morrot, así como el transporte regular de contenedores entre el Puerto de Barcelona y las terminales de Zaragoza- Plaza, Pla de Vilanoveta y Tarragona.