Se ha puesto a prueba el Plan Interior Marítimo por contaminación marina accidental y la coordinación entre los diferentes agentes. Bilbao es uno de los enclaves europeos con más medios propios para atender este tipo de emergencias. La APB dispone de cuatro contenedores con diferentes barreras de contención, que suman 1.650 metros, a los que se unen las barreras de empresas industriales como Petronor, Tepsa y Esergui, así como los medios de los amarradores y remolcadores Ibaizabal.
Asimismo, el Puerto de Bilbao se encuentra a la cabeza del sistema portuario del Estado en cuanto a capacidad de respuesta frente a posibles siniestros originados por mercancías peligrosas.